Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NEDD8Q15843 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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