Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITSN1Q15811 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITSN1Q15811 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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