Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE3CQ15386 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE3CQ15386 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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