Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GAPVD1Q14C86 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GAPVD1Q14C86 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
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