Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZNF235Q14590 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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