Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDK13Q14004 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CDK13Q14004 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
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