Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPSQ13938 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPSQ13938 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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