Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
KLF9Q13886 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLF9Q13886 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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