Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RUNX3Q13761 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RUNX3Q13761 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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