Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ATP1A4Q13733 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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