Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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FHL3Q13643 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FHL3Q13643 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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