Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH18Q13634 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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