Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL4AQ13619 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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CUL4AQ13619 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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CUL4AQ13619 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL4AQ13619 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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