Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PWP1Q13610 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PWP1Q13610 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms