Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDAC1Q13547 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC1Q13547 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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