Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LSAMPQ13449 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LSAMPQ13449 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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