Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
XRCC4Q13426 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XRCC4Q13426 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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