Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MRPL28Q13084 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MRPL28Q13084 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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