Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF1Q13077 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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TRAF1Q13077 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRAF1Q13077 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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TRAF1Q13077 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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