Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FOXF2Q12947 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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