Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
LMAN2Q12907 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LMAN2Q12907 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms