Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.35e-12■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.575e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.35e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.085e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SERPINF2-205ENST00000453723 838 ntTSL 314.82□□□□□ -0.045e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CMPK1-201ENST00000371870 812 ntTSL 218.59■□□□□ 0.571e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.361e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.348e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 RAB6A-208ENST00000541795 1812 ntTSL 217.09■□□□□ 0.338e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.218e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ZDHHC9-203ENST00000406492 737 ntTSL 512.22□□□□□ -0.458e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.528e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.548e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KIF2C-207ENST00000480574 783 ntTSL 511.04□□□□□ -0.648e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 HLTF-202ENST00000392912 3896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.868e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 HLTF-208ENST00000494055 3633 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.978e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 HLTF-201ENST00000310053 5317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.178e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ZDHHC9-204ENST00000433917 581 ntTSL 36.48□□□□□ -1.378e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 RAB6A-203ENST00000400470 522 ntTSL 33.4□□□□□ -1.878e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.323e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 322.52■■□□□ 1.23e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.143e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.823e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 514.44□□□□□ -0.13e-8■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CCAR1-206ENST00000494903 570 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DDX19A-205ENST00000562509 564 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 THRAP3-204ENST00000478853 380 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.55■□□□□ 0.246e-12■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DDX19A-212ENST00000569244 557 ntTSL 415.76■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DDX19A-203ENST00000561574 577 ntTSL 415.22■□□□□ 0.031e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CCAR1-209ENST00000538031 754 ntTSL 313.19□□□□□ -0.31e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-215ENST00000580879 583 ntTSL 313.15□□□□□ -0.31e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DDX19A-208ENST00000566167 551 ntTSL 512.84□□□□□ -0.351e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 MBTPS1-201ENST00000343411 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.481e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.492e-12■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 MBTPS1-216ENST00000570064 3086 ntTSL 211.62□□□□□ -0.551e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 MBTPS1-204ENST00000562886 3333 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SEC24A-201ENST00000322887 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.661e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-12■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-220ENST00000583070 907 ntTSL 510.6□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-211ENST00000579324 2010 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.771e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-206ENST00000577645 869 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-210ENST00000579298 1890 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.91e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-212ENST00000579557 817 ntTSL 59.3□□□□□ -0.921e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-216ENST00000581104 2233 ntTSL 29.28□□□□□ -0.921e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-203ENST00000540768 1926 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.941e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 NUP85-208ENST00000578830 922 ntTSL 58.74□□□□□ -1.011e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SEC24A-202ENST00000398844 6299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 VMP1-213ENST00000591877 791 ntTSL 37.37□□□□□ -1.231e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.291e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 VMP1-215ENST00000592619 838 ntTSL 55.75□□□□□ -1.491e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CCAR1-208ENST00000536391 552 ntTSL 44.58□□□□□ -1.681e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.831e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.931e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 DAD1-202ENST00000489532 339 ntTSL 32.71□□□□□ -1.981e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 C16orf70-203ENST00000563853 1025 ntTSL 314.07□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.57■■□□□ 1.25e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.715e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.035e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.059e-11■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-206ENST00000451800 847 ntTSL 520.66■□□□□ 0.91e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-209ENST00000474824 618 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 KYAT1-207ENST00000462722 2089 ntTSL 1 (best)12.15□□□□□ -0.461e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 CCAR1-216ENST00000543706 869 ntTSL 55.68□□□□□ -1.56e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 SRPK1-211ENST00000510290 621 ntTSL 35□□□□□ -1.618e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 SRPK1-203ENST00000373821 565 ntTSL 52.72□□□□□ -1.978e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ATAD2-202ENST00000517666 4995 ntTSL 511.89□□□□□ -0.511e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ATAD2-205ENST00000521903 5143 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 ATAD2-203ENST00000519124 4650 ntTSL 1 (best)6.33□□□□□ -1.41e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.368e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FADS1-219ENST00000545245 709 ntTSL 416.39■□□□□ 0.214e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.164e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FADS1-220ENST00000545405 582 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FADS1-221ENST00000545986 574 ntTSL 411.31□□□□□ -0.64e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 FADS1-212ENST00000539419 563 ntTSL 411.09□□□□□ -0.634e-9■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 HMBOX1-209ENST00000522468 817 ntTSL 314.03□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 410.21□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.782e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-204ENST00000392563 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.912e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 GRB2-205ENST00000392564 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RERE-216ENST00000505225 533 ntTSL 26.9□□□□□ -1.32e-7■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RBL2-203ENST00000544405 2025 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-6■■□□□ 14.4
ILF3Q12906 RBL2-208ENST00000567964 838 ntTSL 55.08□□□□□ -1.62e-6■■□□□ 14.4
Retrieved 100 of 15,265 protein–RNA pairs in 152.8 ms