Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SSRP1Q08945 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms