Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UBXN1Q04323 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBXN1Q04323 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms