Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GCNT1Q02742 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GCNT1Q02742 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms