Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DSG1Q02413 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms