Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC6A3Q01959 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms