Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPIBQ01892 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms