Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFITM3Q01628 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IFITM3Q01628 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms