Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DEFA6Q01524 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DEFA6Q01524 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms