Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDK6Q00534 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDK6Q00534 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms