Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTA1P68133 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms