Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HERVK_113P62684 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms