Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NME5P56597 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NME5P56597 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME5P56597 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME5P56597 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms