Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ATP12AP54707 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms