Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP98P52948 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP98P52948 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP98P52948 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms