Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DAP3P51398 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DAP3P51398 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DAP3P51398 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms