Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KRT6CP48668 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRT6CP48668 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms