Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP8P40818 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP8P40818 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP8P40818 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP8P40818 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP8P40818 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms