Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP62P37198 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP62P37198 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP62P37198 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms