Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TGFBR1P36897 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGFBR1P36897 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms