Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRS3P32247 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRS3P32247 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms