Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB5P28074 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB5P28074 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms