Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PLNP26678 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PLNP26678 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PLNP26678 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms