Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHMLP26374 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHMLP26374 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHMLP26374 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHMLP26374 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms