Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTX3P26022 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTX3P26022 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTX3P26022 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTX3P26022 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms