Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK11BP21127 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDK11BP21127 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms