Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EFNA1P20827 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EFNA1P20827 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms