Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CXCL2P19875 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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