Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATF1P18846 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATF1P18846 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATF1P18846 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms